紫鑫药业现享有吉林紫鑫敦化医药药材有限公司、吉林紫鑫红石种养植有限公司、吉林紫鑫般若药业有限公司、吉林紫鑫初元药业有限公司、吉林草还丹药业有限公司、吉林紫鑫研究有限公司、吉林紫鑫研发有限公司等7家子公司。通化紫金药业有限责任公司系由于1998年5月25日由敦化市康平有限责任公司、敦化市吉泰经贸有限责任公司联合发动成立的有限责任公司。1998年11月，根据公司临时股东会通过的注册资本扩股决议，追加柳河沈飞合联工贸有限责任公司、吉林省霄峰广告有限公司、柳河日新餐有限责任公司三家股东，注册资本扩股公司注册资本为3,000.00万元。

2001年2月9日，经吉林省人民政府《关于通化紫金药业有限责任公司依法更改为通化紫金药业股份有限公司的国家发改委》的批准后，以通化紫金药业有限责任公司截至2000年11月30日的净资产等额剪成股份整体更改为股份有限公司，股本总额为3,565万元。同年5月28日，公司名称更改为吉林紫鑫药业股份有限公司。

2002年4月1日，经吉林省人民政府《关于表示同意吉林紫鑫药业股份有限公司注册资本扩股的国家发改委》的批准后，以2001年末总股本为基数每10股送来4.2股，向全体股东转增股份总额14,973,000.00元，注册资本后的股本总额为50,623,000.00元。吉林紫鑫在2002年打消了上市的点子。2002年8月，紫鑫药业开始大力打算涉及材料，并转入辅导。经过两年多的希望，紫鑫药业于2003年冬开始向证监会提交上市申请人。

然而，在2004年6月29日的发审会上，吉林紫鑫的“上市处子秀”因种种原因而并未通过发审。

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